Alfredo vient de mourir. Pour Salvatore, cinéaste en vogue, c’est tout un pan de son passé qui s’écroule. On l’appelait Toto a l’époque. Il partageait son temps libre entre l’office où il était enfant de chœur et la salle de cinéma paroissiale, en particulier la cabine de projection où régnait Alfredo.

Kuroh et Neko sont toujours persuadés que Yashiro est toujours vivant. Tandis qu’ils tentent de découvrir ce qu’il est advenu de lui, Reisi Munakata, le Roi bleu du clan « Scepter 4 », tente toujours de faire le deuil de son ami Mikoto, et Anna, la nouvelle Reine rouge du clan « HOMRA », bat le rappel de ses anciens camarades dispersés. De leur côté, le Roi vert et les membres de son clan « Jungle » repassent à l’action…

Des factions s’affrontant à l’aide de pouvoirs psychiques ont consolidé leur emprise sur les hautes sphères du Japon. Au nombre de sept, ces clans sont chacun guidés par un leader charismatique et ultra puissant baptisé « Roi ». Longtemps déchiré par ces guerres claniques, le Japon connaît à présent une période de calme. C’est dans cette paix de façade qu’un membre de la HOMRA, le clan rouge, est sauvagement assassiné. La vidéo de sécurité prise sur les lieux du crime accuse Yashiro Isana, un étudiant lambda qui ne semble appartenir à aucun gang. Mikoto Suô, le redoutable Roi rouge, décide de lancer ses hommes à la poursuite du jeune étudiant. Mais Reishi Munakata, le Roi bleu à la tête du « Sceptre 4 », ne compte pas laisser la HOMRA se faire justice en toute impunité… Mais qui est donc Yashiro Isana, l’homme sur le point de faire voler la paix en éclats ?

Mac Ramsey et Li Ann Tsei ont été élevés ensemble aux côtés d'un parrain du crime organisé. Mais un jour, ils décident de quitter le milieu. Leur tentative ayant échoué, Li Ann est arrêté, et Mac laissé pour mort... Pourtant bel et bien vivant, Mac atterrit dans une obscure agence gouvernementale qui lutte contre la mafia. Il y retrouve Li Ann, devenue l'amante de son co-équipier Victor, un ex-flic. Chacun devra oublier ses rancoeurs quand la Directrice de l'agence les oblige à former un trio de choc...